Une série d'expérimentations a été réalisée afin de mesurer l'activité dénitrifiante liée aux biodermes périphytiquesse développant sur le lit de la Garonne. Cette activité et la production au sein des biodermes ont été mesurées in vitrodans des chambres photo-respiratoires.La dénitrification a été évaluée par l'accumulation de protoxyde d'azote (N2O) après l'inhibition de sa réduction parl'acétylène. Le N2O produit a été mesuré sur un chromatographe en phase gazeuse à détecteur à capture d'électrons.L'état du bioderme est caractérisé par les paramètres de biomasse, de pigments chlorophylliens et d'activité photosynthétiqueet respiratoire. La production de N2O liée aux biodermes est immédiate et linéaire. En présence de l'acétylèneet à l'obcurité, le taux horaire moyen de dénitrification atteint des valeurs de 423 µg N. g-1 M.O. h-1 dans les chambresanaérobies contre 203 µg N. g-1 M.O. h-1 dans les chambres aérées (7 mg O2 l-1). L'activité dénitrifiante est inhibée à99 % à la lumière et, en présence de l'acétylène, son taux ne dépasse guère 1 µg N. g-1 M.O. h-1.Les taux mesurés dans nos chambres photo-respiratoires, dans les conditions de température et d'éléments nutritifsproches de celles du fleuve, sont très élevés par rapport aux valeurs citées dans la littérature. Ils témoignent de l'importantecontribution qu'apportent les biodermes au processus de dénitrification et, par conséquent, à la réduction de lacharge en nitrates de l'eau de la Garonne.

L'expérimentation, menée au cours d'un cycle annuel sur deux secteurs différents de la rivière Charente à l'aval d'Angoulème, a pour objectif de quantifier le taux de dénitrification pour les besoins d'un modèle hydrologique nitrates.La méthode de blocage du stade final de la réaction de dénitrification à l'acétylène a permis le dosage du protoxyded'azote à partir de cloches à sédiment et d'un conteneur immergé en pleine eau.Les résultats montrent que, si ce phénomène n'a pas lieu dans la tranche d'eau, la vitesse de dénitrification à l'interfaceeau-sédiment, facteur K exprimé en mg de nitrates dénitrifiés par m2 par jour, peut être considérée comme constante et indépendante des variations en température, en teneurs en nitrates et oxygène dissous de l'interface.Sur un cycle annuel, en l'absence d'influence marquée des paramètres environnementaux, le taux moyen de dénitrification dans la rivière Charente est de 682 mg de NO3- /m2/ j.La comparaison des mesures obtenues par cette méthode à celles évaluées par le calcul (bilan azoté) montre qu'il estpréférable d'estimer le taux de dénitrification par dosage direct plutôt qu'à partir de l'analyse des formes de l'azote(disparition du NO3 - ou défaut du bilan).

Les bactéries du fer isolées des eaux et des sédiments du Sud-Ouest de la France sont soit autotrophes (g. Gallionella), soit hétérotrophes (g. Sphaerotilus, Crenothrix, Siderocapsa, etc...).Les premières sont inféodées à la présence de fer ferreux, alors que les secondes occupent des niches écologiques plus variées, quoique toujours aux limites de stabilité du fer ferreux dans les eaux. Ce dernier point, joint à leur exigence en matière organique, facteur de mobilisation du fer, explique leur rôle dans le colmatage biologique des drains. De plus, il est probable que l'influence des ferrobactéries déborde largement le cadre du cycle du fer.